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2,4-二氯苯氧乙酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合作用
发表时间：2016-02-15 浏览量：2447 下载量：875
| 全部作者： | 夏开心，张国文 |
| 作者单位： | 南昌大学食品科学与技术国家重点实验室 |
| 摘 要： | 在生理酸度（pH=7.4）条件下，采用多种光谱学技术包括，紫外-可见吸收光谱法（ultraviolet-visible absorption，UV-vis）、荧光光谱法、圆二色谱法（circular dichroism，CD）及红外光谱法（Fourier transform infrared apectroscopy，FT-IR）结合分子模拟的方法，研究2,4-二氯苯氧乙酸（简记为2,4-D）与小牛胸腺DNA（calf thymus DNA，ctDNA）的体外结合性质，并分析其相互作用机制。2,4-D对ctDNA的熔点和黏度影响不明显，以及与溴化乙锭（ethidium bromide，EB）、吖啶橙（acridine orange，AO）探针竞争实验结果显示，2,4-D主要通过沟槽方式与ctDNA相互作用。FT-IR和CD分析表明，2,4-D优先结合在ctDNA的A、T碱基上，并在一定程度上对ctDNA的碱基堆积和双螺旋结构产生干扰，使ctDNA的构象由B型向A型转变，分子模拟结果证实了实验结果并直观展示了2,4-D与ctDNA的结合模式及空间结合姿态。凝胶电泳实验表明，2,4-D对pUC18质粒DNA未产生明显损伤。 |
| 关 键 词： | 食品添加剂技术；2,4-二氯苯氧乙酸；小牛胸腺DNA；结构模式；光谱法；分子模拟 |
| Title： | Groove binding interaction between 2, 4-dichlorophenoxyacetic acid and calf thymus DNA |
| Author： | XIA Kaixin, ZHANG Guowen |
| Organization： | State Key Laboratory of Food Science and Technology, Nanchang University |
| Abstract： | The interaction between 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) and calf thymus DNA (ctDNA) in vitro was investigated by multispectroscopic methods containing ultraviolet-visible absorption (UV-vis), fluorescence, circular dichroism (CD) and Fourier transform infrared apectroscopy (FT-IR) with molecular modeling under simulate physiological conditions (pH=7.4). The 2,4-D caused little change in melting temperature and viscosity of ctDNA, and the competition experiments of ethidium bromide (EB) and acridine orange (AO) confirmed that the groove binding occurred between 2,4-D and ctDNA. Analysis of the FT-IR and CD spectra indicated that 2,4-D preferentially bound to adenine and thymine bases, and perturbed the base stacking and double helix of ctDNA, leading to a transformation from the B-form of ctDNA to A-form, and the molecular docking further verified the results of experiments and intuitively showed the binding pose of 2,4-D with ctDNA. Additionally, the gel electrophoresis results indicated that 2,4-D did not induce any obvious cleavage of supercoiled pUC18 plasmid DNA. |
| Key words： | food additives technology; 2,4-dichlorophenoxyacetic acid; calf thymus DNA; binding mode; spectroscopy; molecular modeling |
| 发表期数： | 2016年2月第3期 |
| 引用格式： | 夏开心，张国文. 2,4-二氯苯氧乙酸与小牛胸腺DNA的沟槽结合作用[J]. 中国科技论文在线精品论文，2016，9（3）：284-293. |
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